Nace la Orden Hospitalaria de San Juan de Dios en Granada, España, al calor de la vida testimoniante de Juan de Dios. Oficialmente es reconocida por la Iglesia como Familia Religiosa de Derecho Pontificio el 1 de enero de 1572.

A raíz de la muerte de su fundador comienza su expansión, primero en España, luego en Italia, hasta que, a finales del siglo XVI, en 1596, llegaban a Cartagena de Indias, Colombia, los seis primeros hermanos de San Juan de Dios. De esta semilla que prende en tierras de América Latina, florecerían con el tiempo tres provincias religiosas en Cartagena de Indias, Lima y México capital, estarán lo que hoy llamamos Curias Provinciales, extendiendo desde ésta última su presencia a las islas Filipinas. En 1604 la Orden Hospitalaria arranca en México, de manos de Fray Cristóbal Muñoz. La presencia benéfica de la Orden se prolongará a lo largo de dos siglos en tantas ciudades que, como la de Atlixco en el estado de Puebla con el Hospital de Nuestra Señora de la Concepción, mejor conocido como de San Juan de Dios, se familiarizan con el hábito de los Hermanos. Toda esta floración de hospitales acabó al estallar la lucha de la independencia de México por un lado, y por otro a causa de las leyes dictadas contra las Ordenes Religiosas desde España.

Pasaron los años, hasta que el Beato Benito Menni restaura la Orden "en su cuna", en España, abriendo un hospital en Barcelona en el año de 1867. A ese primer hospital con el que inicia la obra de la Restauración, le siguen otros, dedicados a niños escrofulosos y al enfermo mental. Así surge la Delegación General de España hasta que en 1884 se convierte en la Provincia de España, siendo el P. Menni el primer Provincial de la misma. El número de hospitales en España y Portugal va en aumento hasta que el año de 1928 nace la Provincia de Portugal formada con las casas que tiene, tanto en la metrópoli como en las Islas Azores. En el año de 1901, la restauración se extiende a México, donde se hacen presentes los Hermanos de San Juan de Dios en las ciudades de Guadalajara y Zapopan, Jalisco y en Cholula, Puebla.

El Capítulo General de 1934 que se celebra en Carabanchel Alto, Madrid, toma la decisión de dividir la Provincia Española en tres provincias. Las casas de México se constituyen el Delegación Provincial de la Provincia de Aragón y América Central. Después de superado el trauma y la sangre de los mejores religiosos que supone la guerra civil española de 1936, emprende la Provincia de Aragón su expansión en ultramar abriendo dos casas en Cuba y posteriormente la Clínica San Rafael, en México, Distrito Federal. Sigue el crecimiento y surgen las vocaciones nativas, y el Capítulo General de 1979 constituye en Viceprovincia las casas de México hasta que el Capítulo General de 1994, que se celebra en Santa Fe de Bogotá, como tributo al V Centenario de la Evangelización de América Latina, eleva a la categoría de Provincia con el nombre canínico de "Nuestra Señora de Guadalupe" a estas mismas casas de México y Cuba, convirtiéndose la Clínica San Rafael en México, D.F. en la Sede de la Curia Provincial de los Hermanos Hospitalarios de San Juan de Dios en México y América Central. 

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